TBN的資料庫隨著開放資料的新增不斷成長，資料來源不僅有農業部生物多樣性研究所（TBRI）的研究人員所建立的研究資料與標本典藏資料，亦有TBRI與公眾共同蒐集的公民科學資料，並再彙整國內外開放資料庫的資料，以供使用者使用。
農業部生物多樣性研究所
- TBRI 研究資料管理系統 RA（農業部生物多樣性研究所管理，僅供內部使用）
- TAIE 農業部生物多樣性研究所植物標本館
農業部生物多樣性研究所與公眾或他單位合作的公民科學計畫
國內外開放資料庫
TBN的資料庫隨著開放資料的新增不斷成長，資料來源不僅有農業部生物多樣性研究所（TBRI）的研究人員所建立的研究資料與標本典藏資料，亦有TBRI與公眾共同蒐集的公民科學資料，並再彙整國內外開放資料庫的資料，以供使用者使用。